public class BlastClustReader
extends java.lang.Object
Constructor and Description |
---|
BlastClustReader(int sequenceIdentity) |
Modifier and Type | Method and Description |
---|---|
java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> |
getChainIdsInEntry(java.lang.String pdbId) |
java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> |
getPdbChainIdClusters() |
java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> |
getPdbChainIdClusters(java.lang.String pdbId) |
java.lang.String |
getRepresentativeChain(java.lang.String pdbId,
java.lang.String chainId) |
java.util.Map<java.lang.String,java.lang.String> |
getRepresentatives(java.lang.String pdbId) |
int |
indexOf(java.lang.String pdbId,
java.lang.String chainId) |
public java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> getPdbChainIdClusters()
public java.util.Map<java.lang.String,java.lang.String> getRepresentatives(java.lang.String pdbId)
public java.lang.String getRepresentativeChain(java.lang.String pdbId, java.lang.String chainId)
public int indexOf(java.lang.String pdbId, java.lang.String chainId)
public java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> getPdbChainIdClusters(java.lang.String pdbId)
public java.util.List<java.util.List<java.lang.String>> getChainIdsInEntry(java.lang.String pdbId)