Class BaseIlluminaDataProvider

    • Field Detail

      • lane

        protected final int lane
    • Constructor Detail

      • BaseIlluminaDataProvider

        public BaseIlluminaDataProvider​(int lane,
                                        OutputMapping outputMapping)
    • Method Detail

      • addData

        protected void addData​(ClusterData clusterData,
                               picard.illumina.parser.PositionalData posData)
      • addData

        protected void addData​(ClusterData clusterData,
                               picard.illumina.parser.PfData pfData)
      • addData

        protected void addData​(ClusterData clusterData,
                               picard.illumina.parser.BarcodeData barcodeData)
      • addReadData

        protected void addReadData​(ClusterData clusterData,
                                   int numReads,
                                   picard.illumina.parser.BaseData baseData)
      • addReadData

        protected void addReadData​(ClusterData clusterData,
                                   int numReads,
                                   picard.illumina.parser.QualityData qualityData)
      • addReadData

        protected void addReadData​(ClusterData clusterData,
                                   int numReads,
                                   CbclData cbclData)